Microbial Genomics Pelatihan Daring di Indonesia

Mikrobiologi genomika dan metagenomika menggabungkan teknologi penurunan dan analisis komputasi untuk memprofilkan komunitas mikroba, mengkarakterisasi genom, dan mendeteksi sifat fungsional seperti ketahanan antimikroba.

Pelatihan ini yang dibimbing oleh instruktur (online langsung atau langsung tatap muka) ditujukan bagi peneliti dan bioinformasian pada tingkat pemula hingga menengah yang ingin melakukan analisis praktis terhadap data penurunan genomika mikroba dan metagenomika.

Pada akhir pelatihan ini, peserta akan mampu:

• Mendeskripsikan workflow penurunan umum dan format file kunci yang digunakan dalam genomika mikroba.
• Melakukan kontrol kualitas dan pra-pemrosesan terhadap baca mentah NGS.
• Melakukan profil taksonomi menggunakan pendekatan marker dan k-mer.
• Mengasemblas dan menandai genom mikroba dan plasmid.
• Mendeteksi SNP, membangun filogeni, dan menafsirkan struktur populasi.
• Memprediksi gen ketahanan antimikroba dan meringkaskan profil fungsional.
• Menggunakan workflow yang dapat direproduksi dengan Conda, Docker, dan laporan berbasis notebook.

Format Kursus

• Kuliah memperkenalkan konsep dan alat (20%).
• Sesi praktis menggunakan dataset contoh (60%).
• Diskusi terbuka dan analisis terarah sehingga peserta dapat menerapkan metode pada data mereka (20%).

Opsi Penyesuaian Kursus

• Untuk meminta workshop yang disesuaikan berfokus pada metagenomika klinis, lingkungan, atau industri, silakan hubungi kami untuk mengatur.